[2] Regresó a Perú en 1995 a Alianza Lima y, junto con nombres como Waldir Sáenz, Marcial Salazar, Juan Jayo, entre otros más, hizo buena campaña con el cuadro de la Victoria.
En este año tan recordado principalmente por los clásicos ante Universitario (6-3 y 1-0), Marquinho anotó de tiro libre en ambos partidos.
En 1997, regresa a Alianza Lima, donde fue campeón con el cuadro blanquiazul que obtenía un título después de dieciocho años.
En el año de 1999, regresa al Sport Boys del Callao tras siete años.
Para este año, Boys termina en el quinto puesto y, junto con Abel Lobatón, Marquinho se consagra goleador del equipo rosado con trece tantos.
Es considerado por muchos hasta el día de hoy como el mejor extranjero del Sport Boys y Alianza Lima y uno de los mejores extranjeros del fútbol peruano.«Copia archivada».