Elsner creció en Francia y comenzó su carrera en las inferiores del Niza.

[3]​[4]​ En 2012, Elsner se convirtió en asistente técnico del NK Domžale.

Un año después, se convirtió en el entrenador del primer equipo.

[8]​En la campaña 2019-20, el club ocupaba la penúltima plaza cuando se suspendió el torneo por la pandemia de COVID-19, por lo que terminó descendiendo a la Ligue 2 tras una decisión tomada por la Ligue de Football Professionnel.

[15]​En la siguiente campaña, logró que el equipo permaneciera en la máxima categoría al finalizar en la 15ª posición.