La temporada 2020-21 vino precedida por todo lo ocurrido con la pandemia de coronavirus, que hizo imposible que se completase la Liga de Campeones de la EHF femenina 2019-20, y que afectó a la competición en su edición de 2021, haciendo que a algunos equipos se les diese por perdidos partidos de la fase de grupos y de los octavos de final.

Los 16 equipos de la Champions estarán divididos en dos grupos de ocho equipos cada uno, pasando los dos mejores equipos de cada grupo a cuartos de final y quedando totalmente eliminados de la competición los dos últimos de cada grupo.

Los cuatro equipos restantes de cada grupo se enfrentarán en un playoff del que saldrán los equipos restantes para los cuartos de final.

Una vez disputados los cuartos de final, se realizará una Final Four, donde se conocerá al campeón de la edición.

El 10 de febrero de 2021, el Comité Ejecutivo de la EHF decidió cambiar el formato de competición de la Champions masculina y femenina debido a la situación generada por el COVID-19, que obligó al aplazamiento de partidos y que a algunos equipos se les diesen por perdidos estos, pasando a clasificarse todos los equipos, que se enfrentarían en octavos de final según su posicionamiento en la fase de grupos.