La temporada 2012-13 de la Liga Femenina fue la 50.ª temporada de la liga femenina de baloncesto.
Se inició el 12 de octubre de 2012 y acabó el 30 de marzo de 2013.
Los playoffs sirvieron a Rivas Ecópolis quien ganó al Perfumerías Avenida en los playoffs 2-0.
[1] Fuente: FEBTras la temporada, UNB Obenasa y Hondarribia-Irún renuncian a la categoría.
Sus plazas las ocupan el Toyota Recreativo Conquero, que había descendido, y el Clickseguros Casablanca (de Zaragoza).