Tiene su sede en Nyon (Suiza)[1]​ y cuenta, en 2016, con la afiliación de 52 federaciones nacionales.

La LEN fue fundada el año 1926 en Budapest por representantes de 8 federaciones nacionales: Dinamarca, Finlandia, Francia, Noruega, Países Bajos, Polonia, Suecia y Suiza.

Estos campeonatos incluían a la natación, nado sincronizado, saltos y waterpolo.

En 1991 se realizó el primer Campeonato Europeo de Natación en Piscina Corta en Gelsenkirchen (Alemania).

En estos campeonatos solo se realizan pruebas de natación en una piscina de 25 m. Entre los eventos competitivos más importantes que la LEN organiza regularmente se encuentran: La estructura jerárquica de la federación está conformada por el presidente, el secretario general y los vicepresidentes, el Congreso (efectuado cada dos años), el cuerpo ejecutivo y los comités técnicos.