Debido a una niñez con enfermedades, se interesó tempranamente por la medicina herbal, y a los catorce años, recorrió la región ubicando especies medicinales.
Se doctoró con la tesis Compositae Japonicae, que luego republicará con ampliaciones.
En 1932 su profesor guía, el Dr. Koidzumi, fundó la revista "Acta Phytoxaxonomica et Geobotanica.
Kitamura se unió a ese emprendimiento editorial.
Realizó expediciones botánicas a China, la isla Hachijo, Corea y Taiwán.
En 1953, la Universidad de Kioto organizó una extensa expeidción asiática, llevando a Kitamura como su botánico jefe.
Kitamura publicó en 1960 su obra Flora of Afganistán.
En 1936 se casó con Michi Nakamura, con la que tuvo cinco hijos, tres varones y dos mujeres.
Se poseen 1000 registros IPNI de sus identificaciones y clasificaciones de nuevas especies, las que publicaba habitualmente en : Acta Phytotax.