El FC Qarabag Khankendi es un equipo de fútbol de Azerbaiyán que juega en la Liga Aficionada AFFA, la cuarta división de fútbol en el país.
Fue fundado en el año 1927 en la ciudad de Khankendi,[1] aunque sus partidos los juega en la capital Bakú,[2] y fue campeón nacional en una ocasión en 1977 durante el periodo de la Unión Soviética.
Luego de la disolución de la Unión Soviética y la independencia de Azerbaiyán han sido un equipo de categoría aficionada que nunca han podido abandonar la cuarta división desde su fundación en 1992.