Juan Fernández Franco de Medina (primera mitad del siglo XVII, en La Laguna, Tenerife (Islas Canarias, España) - 16 de septiembre de 1698, San Juan (Puerto Rico)) fue un soldado español que ejerció la gobernación de Puerto Rico entre 1685 y 1690, y entre 1692 y 1698.
Juan Fernández Franco de Medina nació en la primera mitad del siglo XVII (se desconoce el año), en La Laguna, en la isla de Tenerife (Islas Canarias, España).
En 1685 , tras 19 años ejerciendo el oficio, visitando armas en todas las islas de Canarias, fue nombrado gobernador y capitán general de San Juan de Puerto Rico, cargos que ocupó hasta 1690.
Solo dos años después, el 30 de diciembre de 1692, la corona lo vuelve a nombrar para los mismos puestos.
[1] Durante su gobierno, en 1697, pidió el envío de 20 familias canarias a Puerto Rico con el objetivo de poblar Río Piedras, iniciando así una masiva emigración canaria hacia esa isla (que culminaría básicamente en 1898).