Juan Carlos Núñez (Guadalajara, Jalisco, México, 18 de abril de 1983) es un exfutbolista mexicano.

Jugaba de lateral derecho y se retiró en el Club Tijuana en la Primera División de México.

[1]​ Surgido de las fuerzas básicas del Deportivo Toluca.

Debutó con Toluca en la Copa Libertadores 2007 el 21 de febrero en el triunfo de visita al Cienciano por 2 goles a 1.

Llegó al Club Tijuana Xoloitzcuintles de Caliente como refuerzo para el Apertura 2008.