Después del partido, Reyes recogió la pelota y se la envió a sus padres.

Terminó octavo en la votación para Novato del Año de la Liga Nacional.

Antes de la temporada 2004, los Mets firmaron la estrella japonesa Kazuo Matsui, cuya única condición a la firma era que él tuviera la oportunidad de jugar su posición normal, el campocorto.

Reyes terminó con una decepcionante temporada con un promedio de bateo de.255, 14 carreras impulsadas y 19 bases robadas en 53 partidos.

En 161 partidos en los que tuvo 48 hits de extrabases, 58 remolcadas y 60 bases robadas.

Sin embargo, también encabezó a todos los torpederos de la Liga Nacional en errores con 18.

Durante los entrenamientos de primavera en 2006, los Mets trajeron al exjugador Rickey Henderson como un instructor especializado.

Se hizo muy conocido por los apretones de manos elaborados que crea con sus compañeros para celebrar carreras anotadas.

Dos días más tarde, se convirtió en el segundo jugador en la historia de los Mets en registrar al menos 50 bases robadas en temporadas consecutivas.

Los Mets aseguraron su lugar en los playoffs, y Reyes experimentó en la postemporada por primera vez en su carrera.

A pesar de que bateó apenas.167 en la serie, tuvo una gran actuación en situaciones clave, anotando la carrera del triunfo en el Juego 1, remolcando la carrera de la ventaja en el Juego 2, y tocando la carrera del empate en el sexto inning del Juego 3.

Reyes también empató el récord de los Mets por robar al menos una base en cuatro juegos consecutivos.

Reyes terminó la temporada con un promedio de bateo de.280, 60 extrabases, 12 jonrones, 57 remolcadas y 78 bases robadas en 160 juegos.

Se consideró llamarlo en septiembre, pero sufrió otra lesión en una corva derecha rota, mientras hacía trabajos de rehabilitación en agosto.

En su próximo turno al bate conectó un cuadrangular de dos carreras contra Phil Hughes.

Sin embargo Reyes asistió al Juego de Estrellas con su familia.

Sin embargo, no participó debido a un tendón de la corva desgarrado.

Jose Reyes acompañado de John Buck, Mark Buehrle y Emilio Bonifacio jugarían la próxima temporada 2013 en Toronto.

Reyes representó a la República Dominicana en el Clásico Mundial de Béisbol 2006.

En 6 turnos al bate, Reyes registró un hit y una carrera anotada, así como dos bases robadas.

Reyes terminó el torneo con apenas un hit y 2 anotadas en 9 turnos al bate.

Reyes era un amigo cercano del ex lanzador derecho José Lima.

la gente en la República Dominicana ama a este hombre en gran cantidad, por lo que es un día muy duro no sólo para el pueblo dominicano, sino para todo el mundo por la clase de tipo que era.

[18]​ Reyes creó un sello discográfico llamado El 7 Music, cuyo nombre fue inspirado por su número de uniforme.

[19]​ En mayo de 2011, Reyes lanzó su canción debut, "Bate Roto", la cual se promocionó en las estaciones de radio en español y en los clubes nocturnos en los Estados Unidos y la República Dominicana.

[20]​ Cuenta con dos producciones discográficas: El Pelotero (2021) y Místico (2023), con participación de diversos artistas y productores de música urbana latina como Arcángel, Duki, Jon Z, Eladio Carrión, Chimbala, Emy Luziano, entre otros.

[21]​ En 2023, se sumó a la nueva temporada del reality de Telemundo, La Casa de los Famosos, para convivir con otros reconocidos artistas como Thalí García, Gregorio Pernía, Lupillo Rivera y Maripily Rivera.