Debido a sus grandes actuaciones en el filial, Josep Guardiola le cita para algunos partidos con el primer equipo, aunque viendo finalmente todos los encuentros desde el banquillo.

A principios de 2012, Isaac Cuenca firma contrato con el F. C. Barcelona hasta 2015 pasando así a formar parte de la primera plantilla, dejando definitivamente el filial blaugrana.

[5]​ Realiza su debut el 10 de febrero frente al Roda JC Kerkrade el cual resultó en empate.

Durante el mercado invernal de 2016 abandonó el club turco para regresar a España, uniéndose a las filas del Granada Club de Fútbol con quienes firmaría un contrato por una temporada y media.

[11]​ Al finalizar el primer año rescindió su contrato e inició la pretemporada con el Reus Deportiu antes de decidir su futuro.

[13]​ Un año después fichó por el Vegalta Sendai, siguiendo así en el fútbol japonés.