La organización comenzó como una empresa criminal, subsidiaria de HYDRA, que le brindó apoyo financiero.
[2] Este Imperio Secreto se infiltró en la Corporación Brand de Roxxon Oil, intentó arruinar la reputación del Capitán América,[3] y secuestró a varios mutantes, específicamente a Havok, Polaris, Bestia, Iceman, Ángel, Mente Maestra, Mesmero, Blob y Unus el Intocable: para aprovechar su energía para alimentar un "platillo volante".
[5] El escritor Steve Englehart pretendía específicamente que este tema fuera una metáfora del caso Watergate y la era Nixon.
[6] El Imperio Secreto también buscó eliminar al Caballero Luna quien creían que había interrumpido algunas de sus operaciones (como se ve en Marc Spector: Moon Knight # 19-21).
Caballero Luna abandonó a su compañero, creyendo que estaba muerto, pero en verdad seguía vivo, aunque horriblemente desfigurado y mutilado.
Durante el arco de la historia de Round Robin en The Amazing Spider-Man, Midnight fue enviado a su primera misión: secuestrar al superhéroe Nova para que el Imperio Secreto pudiera transformarlo también en un cyborg.
El plan fue frustrado por la combinación de Nova, Spider-Man, Caballero Luna, Punisher y Night Thrasher.
Sin embargo, en el camino se reveló que su enfermera (y ahora amante), también era un cyborg.
El segundo grupo, una banda de motociclistas llamada "Pretorianos", escapa, aunque con muchas bajas.
Otros encuentros no llevaron a ningún progreso y los miembros del Imperio Secreto abandonaron Las Vegas en un avión.
[9] El Imperio Secreto se ve envuelto en una lucha por controlar rutas de navegación rentables con fines criminales.
[11] Como parte de All-New, All-Different Marvel, el Imperio Secreto luego lucha contra Kate Bishop.