Debutó el 19 de noviembre de ese mismo año ante Cerro Porteño, cuando solo tenía 16 años, en la decimoquinta jornada del Torneo Clausura,[3] pero recién en 2007 pudo jugar en forma continua, al principio pocos minutos y en los últimos partidos del Torneo Apertura, ya como titular.
Más tarde sorprendió en la parte final del torneo por su gran velocidad y la decisión con la que encaraba sus incursiones por el costado derecho.
Al año siguiente el Villarreal regresa a la máxima competición del fútbol español, pero con Pérez jugando pocos minutos, lo que provoca su cesión en enero de 2014 al Olympiacos FC hasta junio del mismo año.
En el 2024 fichó por Unión Comercio, club con que descendió en la Liga 2 al quedar en la última posición del torneo peruano.
En dicho certamen marcó cinco goles con los que terminó siendo uno de los máximos anotadores.
El volante ofensivo llegó a ser considerado por la prensa deportiva de su país como la figura del equipo.