Tras las 6 jornadas correspondientes a esta primera fase, los primeros de cada grupo y los 2 mejores segundos se clasificaron para disputar los cuartos de final, a partidos único, las semifinales y la final.En esta 16.ª edición del torneo participaron 7 equipos franceses, 6 ingleses, 4 galeses, 3 irlandeses, 2 escoceses y 2 italianos.Así pues, durante el mes de noviembre se hace un paréntesis en la competición.Northampton Saints dominó el Grupo 1 desde la primera jornada, logró su pase a cuartos de final en la 5.ª jornada, y además es el único equipo que ha ganado sus 6 partidos en esta primera fase de la Heineken Cup.Leinster Rugby consiguió matemáticamente su pase a cuartos de final en la 5.ª jornada, con solo una derrota, frente a ASM Clermont, y los franceses tendrán que conformarse este año con luchar por la Challenge Cup.Aironi Rugby protagonizó la sorpresa al vencer a Biarritz Olympique en la 3.ª jornada.
