Los fósiles conocidos muestran que los miembros de Hamatophyton poseen tallos organizados en nudos y entrenudos con un ribeteado longitudinal característico.
Los esporangióforos están formados por un pedicelo fuertemente curvado adaxialmente con un esporangio ovoide terminal formador de esporas triletas.
El eje principal tiene crecimiento pseudomonopodial con ramificaciones laterales vegetativas que surgen en ángulo agudo, entre 35 y 75°, a partir de los nudos.
A lo largo del eje fértil y surgiendo de los nudos se localizan los esporangióforos en verticilos de seis formados por cortos pedicelos curvados adaxialmente con un esporangio en su extremo.
El tipo de dehiscencia que presentan es aún desconocida aunque se conoce que las esporas formadas son triletas triangulares o esféricas con entre 27 y 37 mm de diámetro.