Durante la revuelta de Liquid Snake en Shadow Moses, se enfrenta a Solid Snake en varias ocasiones, al tiempo que le brinda asesoramiento a través de CODEC como un contacto sin rostro llamado Deepthroat.
Antes de los eventos del juego, Fox desaparece durante una misión a Outer Heaven y su última transmisión es un mensaje críptico que simplemente dice «Metal Gear».
Metal Gear 2: Solid Snake reveló que Gray Fox dejó FOXHOUND y desertó a Zanzibar Land.
[3] Después de este incidente, Frank desarrolló un gran resentimiento hacia sus superiores, pero no sabía que Gustava más tarde se unió al StB y se encuentra en Zanzíbar como la guardaespaldas del Dr. Kio Marv.
Durante su primer encuentro contra Snake como enemigos, Fox pilotando el Metal Gear mata accidentalmente a Gustava.
Según Hideo Kojima, «el Cyborg Ninja nació del grafiti de Shin-chan».
Naomi Hunter finalmente revela ser la hermana adoptiva de Fox, así como su identidad Cyborg Ninja a Snake.
Metal Gear Rising: Revengeance presenta el exoesqueleto y la espada de Cyborg Ninja como un contenido descargable para Raiden.
[9] En 2013, Kojima declaró estar interesado en desarrollar un juego con Gray Fox como el personaje jugable principal, aunque no asegura que suceda.
En 2008, IGN clasificó a Gray Fox como el tercer villano de Metal Gear («si los jugadores están rescatando a Gray Fox, luchando contra él o mirando alegremente mientras destroza habitaciones enteras de soldados, Gray Fox nunca deja de impresionar»)[12] y el cuarto mejor jefe para luchar en la serie.
4, y agregó: «la serie Metal Gear Solid tiene muchos otros personajes para elegir, pero creemos que Cyborg Ninja sería la selección perfecta».
[16] El regreso de Gray Fox como personaje jugable en Metal Gear Rising: Revengeance fue solicitado por varias publicaciones, incluyendo Electronic Gaming Monthly, Shacknews y ScrewAttack.