Su último equipo como jugador fue el Fulham FC de Inglaterra.

Durante su larga carrera como futbolista profesional, que se extendió durante tres décadas, Karagounis jugó 139 partidos con la selección de Grecia, con la cual disputó dos Copas del Mundo y ganó la Eurocopa en 2004.

Karagounis es un jugador que podía jugar en cualquier posición del mediocampo.

Se formó en el Panathinaikos, club en el que había despuntado desde las categorías inferiores, aunque no llegó a debutar en este equipo en la temporada 1995-96.

[4]​ Meses después anunciaría su retiro definitivo del fútbol profesional.