Actualmente es entrenador y su trabajo más reciente fue como asistente de Maurizio Sarri en el Chelsea F. C. Zola inició su carrera en el USD Nuorese en 1984.

Durante las temporadas siguientes, Zola tuvo que compartir delantera con Jimmy Hasselbaink y Eidur Gudjohnsen.

Con la llegada del entrenador Claudio Ranieri al Chelsea, este procedió a limpiar de veteranos el club, se marcharon jugadores como Gustavo Poyet o Frank Loboeuf y Zola adquirió un rol secundario, pues Ranieri le dio más confianza al islandés Gudjohnsen.

Ese año, fue votado como el mejor jugador que había vestido la camiseta del Chelsea.

UU. fue expulsado frente a Nigeria y posteriormente falló un penal en una tanda decisiva en la Eurocopa 1996, Gianfranco es reconocido en Italia como uno de los jugadores más talentosos que la península haya dado.

En septiembre de 2008, se convirtió en el nuevo técnico del West Ham United.

[6]​ En su primera temporada, los potters terminaron terceros y accedieron a la promoción de ascenso, pero ahí cayeron contra el Crystal Palace.

[11]​ En diciembre de 2016, ficha por el Birmingham City Football Club,[12]​ pero dimitió por los malos resultados tras solo 4 meses en el cargo.