En 1973 comenzó su carrera como jugador-entrenador dirigiendo al AC Le Touquet.

Cuatro años después, ya retirado como futbolista, se dedicó íntegramente a entrenar, dirigiendo al Nœux-les-Mines.

Después pasaría por los banquillos del RC Lens, el Paris Saint-Germain,[2]​ el Liverpool, el Olympique de Lyon y el Aston Villa.

Durante su etapa en el Paris Saint-Germain, llevó al conjunto parisino a la conquista de la Ligue 1 en 1986.

[10]​ Desde julio de 2012, Houllier fue el máximo jefe del fútbol en la empresa Red Bull.