Hacia el 3000 a. C., finalizando el Neolítico, el hombre primitivo vivió en cuevas y abrigos rocosos de estos parajes, donde posteriormente se hizo sedentario.

Dicha región fue conquistada sobre el año 1200 a. C. por una rama de los pueblos indoeuropeos que llegaron a Europa.

En los primeros años del siglo V, el Fuerte romano de Frigiliana fue destruido parcialmente por los pueblos vándalos.

Es probable que desde esa época, según Plinio el Viejo, la agricultura extensiva de Frigiliana fuese el viñedo.

También se sabe que hubo una pequeña presencia de judíos españoles y conversos.

La villa de las Tres Culturas se califica en varios azulejos, existiendo una fuente con los tres símbolos: la cruz, la media luna y la estrella de David; en Calle del Inquisidor.

Este gran edificio, de estilo renacimiento, cuya superficie sobrepasa los dos mil metros cuadrados, se construyó en parte con materiales procedentes del castillo árabe.

Levantaron asimismo estos señores, también por estas fechas, el palacio del Apero, destinado a granero, caballerizas y útiles de labranza.

El cuerpo principal del edificio lo componen tres grandes naves, siendo más espaciosa la central.

Más recientemente se ha modificado el Retablo frontal, los tronos de algunas imágenes y se está intentando sacar a la luz algunas pinturas que en un principio tuvieron los arcos laterales.

Los hermanos mayores más antiguos de los que se tiene referencia fueron D. Antonio Rodríguez y D. Andrés Arrabal.

Como documento estadístico es de un valor incalculable, lo mismo que como obra histórica y caligráfica.

Los primeros años del siglo XIX el pueblo se vio envuelto en la guerra contra los franceses, es famoso de esa época el cura-guerrillero D. Antonio Muñoz.

Entre los años 1810 y 1812 desaparecieron en Frigiliana varios soldados franceses, estos tomaron venganza y ahorcaron a algunos vecinos de la villa en el paraje “La Horca”, nombre que recibió el lugar a partir de estos hechos.

A mediados de 1812 no quedaron tropas francesas en esta zona.

Los albores del siglo XX llevaron a Frigiliana los primeros síntomas del progreso cuando la empresa Nuestra Señora de los Ángeles instaló tendido eléctrico en el término municipal, y se inauguró un año después el primer alumbrado público con un presupuesto total que ascendió a 950 pesetas.

[9]​ La administración política del municipio se lleva a cabo a través de un Ayuntamiento de gestión democrática cuyos componentes se eligen cada cuatro años por sufragio universal.

PA seguirá en la oposición y PSOE se hará cargo de la Alcaldía.

Frigiliana está comunicada con Nerja gracias a la línea regular de autocar VJA -019- MA concedida en concurso público a la empresa concesionaria Autocares Nerja, propiedad de Grupo Fajardo autocares.