Con el paso del tiempo logra consolidarse como titular indiscutible en la defensa junto a Héctor Reynoso y Carlos Salcido, teniendo grandes actuaciones en la liga y en torneos internacionales como la Copa Libertadores, lo que lo catapultó a la Selección Nacional.

Realizó su debut por los granjeros el 23 de agosto frente al Feyenoord por la Supercopa Johan Cruyff entrando en reemplazo de Carlos Salcido a los 76 minutos del encuentro, el cual fue ganado por 0-2 conquistando así el primer título en su nuevo club.

Rodríguez disputó 26 partidos siendo titular en 24 de estos, totalizando 29 presencias contando todas las competiciones (Bundesliga y DFB Pokal).

Bundesliga 2012-13 como en la Europa League, pero tras el mal inicio de temporada del cuadro suabo en la competencia local poco a poco fue perdiendo la titularidad en desmedro de Georg Niedermeier y se vio relegado a la suplencia por el entrenador alemán Bruno Labbadia.

Tras finalizar la primera rueda del torneo, el "Maza" había sido titular en solo 9 encuentros, mientras que en 5 partidos ingresó desde el banco.

En noviembre de 2012 previo al receso del mercado invernal en Europa se especulaba su regreso al fútbol mexicano, con el fin de poder alcanzar regularidad que le permitiera mantenerse como titular en la selección mexicana.

[23]​ De esta forma, Rodríguez se convierte en el primer futbolista en ser campeón tanto con Chivas como con el América.

El "Maza" disputó 22 encuentros en el Clausura 2013, siendo en 21 de estos titular a excepción del partido en que realizó su debut por las Águilas.

El 10 de agosto frente al Atlante por la tercera fecha del Apertura 2013, Rodríguez anota su primer gol por el América en la victoria como visita por 2-4.

[24]​ El equipo mantuvo un buen nivel en la defensa del título, alcanzando el liderato general de la competencia con 37 puntos.

[30]​ Al igual que en el torneo anterior, el "Maza" fue una pieza importante de la defensa del América, llegando a disputar 18 partidos en el Apertura 2013, todos como titular.

Tras la derrota en la final, Miguel Herrera abandonó su cargo como director técnico para asumir definitivamente en la selección mexicana, siendo reemplazado por Antonio Mohamed.

El equipo terminó el Apertura 2014 ubicado en la decimotercera posición con solo 21 unidades, sin lograr acceder a los play-off.

[37]​ El 20 de diciembre disputaron el partido por el tercer lugar frente al Auckland City, empatando a 1 en el tiempo reglamentario.

En el Clausura 2015, Rodríguez se mantuvo como titular indiscutido de La Máquina haciendo dupla en el centro de la defensa junto a Julio César Domínguez, llegando a disputar 16 partidos siendo titular en todos estos.

[39]​ Tras el nuevo fracaso, Tena fue reemplazado en la dirección técnica por Sergio Bueno, quien ratificó al "Maza" como titular en los primeros partidos del Apertura 2015.

El 29 de octubre debuta en el torneo frente a su exequipo, Club Deportivo Guadalajara, siendo derrotados por 3-2 tras un penal convertido por Alan Pulido luego de una mano cometida en el área por Rodríguez en el último minuto del encuentro.