Debido a una enfermedad que contrajo en la infancia sus miembros inferiores quedaron paralizados.

Daudin escribió: "Traité élémentaire et complet d'Ornithologie" que fue uno de los primeros manuales modernos de ornitología que combinó la nomenclatura binomial linneana con las descripciones anatómicas y fisiológicas de Buffon, proyecto que comenzó con gran ímpetu y no logró concluir.

Él fue asistido por su esposa Adèle, quien dibujó 37 de las 100 ilustraciones, y aunque sus libros fueron fracasos comerciales, la pareja no vivió en la pobreza, gracias a la fortuna familiar.

Ella murió de tuberculosis a principios de 1804 y él la siguió un mes después, a los veintisiete años y tres meses.

La abreviatura Daudin se emplea para indicar a François Marie Daudin como autoridad en la descripción y taxonomía en zoología.