Florin Cernat, que actúa de centrocampista ofensivo, empezó su carrera futbolística en las categorías inferiores del Oțelul Galați hasta que, el 29 de agosto de 1998, debuta en la Liga I con la primera plantilla del club en el partido FC Universitatea Craiova 0-1 Oțelul Galați.
Al año siguiente ficha por el Dinamo de Kiev ucraniano.
Allí conquista tres Ligas y cuatro Copas de Ucrania.
En la temporada 2007-08 se marcha cedido al HNK Hajduk Split, que pagó 400000 euros para poder llevárselo.
En la temporada siguiente regresa al Dinamo.