Estudio Ingeniería mecánica en Checoslovaquia y seguidamente en la Universidad de Mánchester (Inglaterra).

Posteriormente decidió ampliar su formación, estudiando en países como la India, Sudáfrica, Suazilandia y los Estados Unidos.

En el año 2008 entró en el gabinete del gobierno, presidido por el presidente Armando Guebuza.

Desde el día 27 de marzo del mismo año, tras diversas rebeliones ocurridas en el país el Ministro de Defensa Tobias Joaquim Dai dejó su cargo y Filipe fue nombrado por el presidente como nuevo ministro.

Finalmente el 26 de octubre el balotaje final le otorgó la victoria a Nyusi con el 57% contra 37% de Afonso Dhlakama del RENAMO y, aunque con victoria aplastante tanto en la presidencia como en el parlamento, la votación hacia el partido decayó mucho con respecto a la elección de 2009 en la que saldría reelecto Guebuza.