[6]​ Tras siete temporadas en las que fue capitán y referente del club rojiblanco, fue traspasado en 2007 al Liverpool por 36 m€.

El mismo año que contrajeron matrimonio nació su primera hija, Nora, en Santiago de Compostela.

[29]​ En 1995 con once años, se incorporó como alevín de primer año a la cantera del Club Atlético de Madrid, tras unas pruebas que realizó al ser seleccionado por los ojeadores del club rojiblanco, al haber marcado ese año 55 tantos.

Durante su estancia en las categorías inferiores del club logró su primer título importante como juvenil en 1996.

[30]​ Un año más tarde firmó un contrato profesional con el Atlético, y, aunque comenzó la temporada aquejado de una lesión en la rodilla izquierda, no incorporándose hasta diciembre[31]​ al equipo que jugaba en la División de Honor Juvenil, la concluyó en Segunda División.

En la temporada 2002-03 Torres tuvo un mayor rendimiento y marcó 14 tantos en 29 apariciones; contribuyendo así a que el Atlético alcanzará la undécima plaza.

[37]​ Durante la temporada 2005-06 Fernando tan solo anotó 13 goles, la cantidad más baja desde su debut en Primera División y el Atlético acabó décimo en la Liga, muy lejos de la clasificación para la competición continental.

Tras ser eliminados, reveló que había rechazado una oferta del Chelsea al término de la temporada 2005–06.

[42]​ Unos días más tarde los medios desmintieron al mandatario rojiblanco revelando que ambas entidades habían llegado a un acuerdo por Torres.

[53]​ Durante la temporada, su progresión fue aumentando y en febrero fue nombrado futbolista del mes,[54]​ cuando anotó cuatro tantos en dos encuentros, incluyendo una tripleta ante el Middlesbrough.

[61]​ En mayo quedó detrás de Cristiano Ronaldo en las votaciones del FWA Footballer of the Year.

[66]​ Ese verano los medios británicos afirmaron que el Chelsea estaba dispuesto a ofrecer 50 millones de libras al Liverpool a fin de hacerse con los servicios del delantero madrileño, mas este dijo que quería quedarse muchos años en su equipo.

[78]​ Torres volvió a la competición en la victoria de su equipo ante el West Bromwich Albion (3-0).

[82]​ Fue candidato al FIFA World Player,[83]​ quedando en tercer lugar tras Cristiano Ronaldo y Lionel Messi.

[87]​ Torres se enfrentó en Champions a su otro máximo rival –el Real Madrid– el 10 y 16 de marzo.

[99]​ Una semana después marcó un triplete ante el Hull City al que los reds humillaron (6-1) en Anfield.

[106]​ Torres finalizó la temporada con 22 goles marcados en 32 encuentros disputados en todas las competiciones, siendo el goleador del Liverpool por segunda vez.

Así, el Chelsea eliminó al Barcelona y se clasificó a la final de la UEFA Champions League 2011-12.

[137]​[138]​ Torres inició la temporada 2012-13 disputando la Community Shield 2012, en donde el Chelsea se enfrentó al Manchester City en Villa Park.

[146]​[147]​ Tras este gran comienzo liguero, el Niño sufrió un traspiés al recibir su segunda expulsión en la Premier League, por doble amarilla, ante el Manchester United que le remontó un 2-0 al Chelsea y los Red Devils ganaron 2-3 (a la expulsión de Torres, se le sumó la de su compañero Branislav Ivanović).

[156]​ En cuartos de final también fue protagonista, le metió tres goles al Rubin Kazan en la eliminatoria, dos en casa y uno en Rusia.

Fernando no celebró el gol por respeto al equipo de su infancia y pidió perdón a la afición por ello.

Su primer partido como milanista lo vio desde la grada ya que se encontraba lesionado con un esguince de tobillo y su debut oficial fue frente a la Juventus.

En dicho partido Fernando fue titular y el Atlético de Madrid venció por dos a cero.

Para Torres, esta era la primera victoria frente al Real Madrid vistiendo la elástica colchonera.

[172]​ Él y David Villa se convirtieron en los máximos anotadores españoles con tres tantos.

[175]​ En el siguiente partido fue duramente criticado, ya que, tras ser sustituido, aparentemente rechazó estrechar la mano al seleccionador nacional Luis Aragonés.

Aunque las lesiones marcaron la temporada impidiéndole disputar un considerable número de encuentros clasificatorios, anotó en un amistoso ante Chile tras sustituir a Villa en la segunda mitad.

En la semifinal ante Alemania perdió la titularidad en detrimento de Pedro (que ya participara en el gol ante Paraguay en cuartos de final nada más sustituir al delantero madrileño), y empezó también en el banco la final, saliendo en los últimos minutos, en los que sufrió una nueva lesión.

Esta sería la última ocasión en que vestiría la zamarra nacional, tras 110 partidos y 38 goles, siendo el tercer máximo goleador histórico de la selección española.