Inicialmente como equipo aficionado, El FC Lviv subió de categoría varias veces en Ucrania hasta llegar a la segunda división, cuando fue comprado por el FC Karpaty Lviv, renombrado y convertido en su equipo de reservas, el FC Karpaty-2 Lviv.El FC Lviv moderno no tiene ninguna relación con el club que existió desde 1992 hasta 2001.FC Lviv fue fundado en 2006 y reemplazó al FC Hazovyk-Skala Stryi, que se declaró en bancarrota que también representaba al Óblast de Lviv, en la segunda división ucraniana.En su temporada de debut, FC Lviv alcanzó el puesto 11º y anotó 45 goles.Al comenzar la siguiente temporada, a principios de 2007, el club se mudó a su nuevo estadio, el Kniazha Arena en Dobromyl, al oeste de Sambir.
Yuriy Kindzerskyi fue el primer presidente que tuvo el club (2006-2009).
