Fue fundado en el año 2017 en la capital Ereván con el nombre FC Avan Academy por Ruben Hayrapetyan con jugadores recién salidos de la academia del Pyunik FC.

A principios de 2018, el club fue comprado por el empresario armenio-ruso Samvel Karapetyan, quien cambió su nombre por Ararat-Moskva.

El club se reorganizó posteriormente como el FC Ararat Moscú y fue inscrito en la Segunda División de Rusia, de la que se proclamó campeón del grupo «Centro».

[2]​ Sin embargo, se negó el certificado para la siguiente temporada que debía competir en la Liga Nacional de Fútbol de Rusia.

[3]​ El club regresó a Armenia y fue renombrado, nuevamente, esta vez a Ararat-Armenia, y participará en la Premier League con este nombre tras recibir una licencia.