Al año siguiente ejerció de médico rural en su provincia natal, en concreto, en el valle de la Valdaliga.
Esta no sería la única experiencia europea de Eugenio Gutiérrez ya que tiempo después ampliaría sus estudios en la maternidad del Hospital general de Viena.
Tras la experiencia parisina volvería a Madrid donde trabajaría con Federico Rubio y Galí en el Instituto de Terapéutica Operatoria, convirtiéndose en su más cercano colaborador.
En 1881 leería su tesis doctoral El vaginismo, obteniendo el grado de doctor.
En su carrera profesional sería especialmente conocido por su asistencia en los partos de la Familia Real española, al menos desde 1906 hasta su muerte en 1914.