En la Serie A 2003-04 fue el cuarto máximo goleador del torneo con 19 goles y se convirtió en el máximo goleador de toda la historia del Lecce, superando al ex-internacional argentino Pedro Pasculli.

Semanas más tarde, fue firmado Mohamed Kallon y se espera una gran pareja de ataque.

Por desgracia, se lesionó en agosto de 2004 y Javier Saviola fue contratado como reemplazo.

Sin embargo, él no jugaba en la Liga Europea de la UEFA, debido a un problema físico y la rotación del equipo.

Chevantón se convirtió en el máximo goleador del equipo en la liga con 10 goles por su actuación en la segunda mitad de la temporada, por delante de Di Vaio y el extremo Olivier Kapo que marcó 5 goles en la liga.

El charrúa era conocido por Chevagol y tenía muy buena relación con Biris Norte.

Según confirmó años más tarde estuvo cerca de fichar por Club Atlético River Plate al salir del club sevillista pero no se dio el pase.

En este club italiano es considerado una leyenda por el desempeño que dio con esa camiseta.

En septiembre del 2015 Javier Chevantón anunció su retiro definitivo del fútbol profesional, agradeciendo por su carrera a todos los clubes de los que formó parte y a sus representantes, el empresario uruguayo Francisco "Paco" Casal y Daniel Delgado.

Chevantón abandonó la selección tras el encuentro contra Bolivia y no fue llamado de nuevo debido a la aptitud personal y la competencia entre los mejores delanteros de Uruguay.