[1]​ Es hijo del exfutbolista Isidro Sánchez y de la cantante Carmen Flores.

[2]​ Quique Flores desarrolló una amplia trayectoria como futbolista, jugando como defensa lateral derecho.

Fue internacional en quince ocasiones, tres partidos con el citado Miguel Muñoz y otros doce con Luis Suárez.

Una vez que dio por finalizada su carrera como futbolista, Quique Sánchez Flores comenzó su formación como técnico en las categorías inferiores del Real Madrid.

[5]​ En la temporada 2004-05 inicia su trayectoria profesional al frente del Getafe C. F., equipo que, como él, debutaba en Primera División.

[6]​ El conjunto madrileño finalizó la temporada en decimotercera posición, manteniendo la categoría de manera holgada y practicando buen fútbol.

[9]​ La presión que caracteriza al banquillo valencianista acabó con la destitución de Quique, pese a haber alcanzado todos los objetivos marcados,[10]​ poco después de iniciarse la temporada 2007-08 (en aquel momento, el equipo era 4.º tras la 9.ª jornada del campeonato).

[17]​ En la Liga, el equipo salió de las últimas posiciones y terminó como 9.º clasificado.

Aunque la segunda parte del torneo no fue tan buena, sí bastó para obtener la permanencia con comodidad.

Aun siendo defensa, marcó 25 goles en Liga (23 de ellos con el Valencia C. F.), uno en Copa y uno en la UEFA Champions League.

Quique Sánchez Flores ha contraído matrimonio en dos ocasiones a lo largo de su vida y mantuvo una relación con Orsi Feher, una presentadora de televisión y modelo húngara a la que conoció mientras entrenaba al Benfica.