Comenzó su carrera en el teatro y posteriormente ha interpretado varios papeles en series de televisión y películas, como por ejemplo Scream 3 (2000), Lovely & Amazing (2001), Match Point (2005) o La librería (2017).
Hija del guionista John Mortimer y de Penelope Glossop, Emily estudió inglés y ruso en el Lincoln college of Oxford.
En 1995 intervino en la serie de televisión The Glass Virgin y participó en varios telefilmes, pero fue en 1996 cuando debutó en la película Los demonios de la noche y El año que murió Elvis.
Un año después actuó en The Saint y en 1999 en Notting Hill.
Su primer papel protagonista fue junto a Bruce Willis en The Kid (2000).