Además, logró participar en la Premier League durante su etapa en el Middlesbrough F. C.. Originalmente delantero, fue retrasando su posición a lo largo de su carrera, llegando a desempeñarse muchas veces como lateral derecho.

[2]​ Emilio Nsue se formó como delantero en las categorías inferiores del R. C. D. Mallorca y del Atlético Baleares (hasta cadete) en donde destacó por su facilidad goleadora (durante esta época varios clubes como el Chelsea se interesaron por su contratación).

Su primer gol lo logró en el Camp Nou en el empate a 1 entre el F. C. Barcelona y Real Mallorca.

En mayo de 2016 ascendió con el Boro a la Premier League y en agosto debutó en esa división, convirtiéndose en el tercer futbolista de origen ecuatoguineano en competir en la liga inglesa, detrás de Lauren Etame Mayer y Pedro Obiang, pero, a diferencia de ellos, fue el primer jugador en militar en la Premier League y a su vez ser internacional absoluto por Guinea Ecuatorial.

Sin embargo, la FIFA consideró que Nsue todavía no era elegible para poder jugar con Guinea Ecuatorial, dado que la FEGUIFUT no les había presentado en tiempo y forma el documento del cambio de asociación, por lo que le dio la victoria por incomparecencia a Cabo Verde por 3:0.

Aunque esta vez Cabo Verde ganó sobre el terreno de juego por 2:1, la FIFA volvió a sancionar a Guinea Ecuatorial con la pérdida del partido con incomparecencia (3:0) e impuso una sanción económica a la federación ecuatoguineana, además de ratificar su decisión previa.