Tiempo más tarde y con 13 años pasaría a integrar la Selección de dicho departamento, para posteriormente arribar a las Formativas del Club Nacional de Football.

Iniciaría en preséptima y formaría parte en adelante de todas las categorías.

Para el comienzo de la temporada 2019 y con el nombramiento de Eduardo Domínguez como nuevo entrenador del primer equipo, Emiliano es ascendido para realizar la pretemporada, alternando durante el año momentos entre el plantel principal y tercera división.

[2]​ A pesar de tener relativamente pocos minutos en cancha, se consagra campeón de dicho torneo y más adelante repetiría por el campeonato uruguayo frente a Peñarol.

En enero de 2020 y con el nuevo entrenador Gustavo Munúa, Emiliano participa en la pretemporada, disputando una serie de amistosos, dejando buenas sensaciones ante River Plate argentino,[3]​ acompañado por Joaquín Trasante en el mediocampo.