Se realizaron el 7 de febrero de 2016[1] y fueron la primera ocasión en que se elijían conjuntamente regidores y demás cargos municipales, ya que históricamente los regidores se escogían junto a las autoridades nacionales en las elecciones presidenciales, hasta que una reforma en el 2009 unificó todas las elecciones municipales en una sola a medio período.
[3] El izquierdista Frente Amplio obtuvo una alcaldía en el cantón de Barva, convirtiéndose en la primera vez en la historia del país que la izquierda consigue el cargo de alcalde[4] y por tanto un gobierno local, así como el también nuevo Partido Republicano Social Cristiano fundado por el expresidente Calderón Fournier obtiene una alcaldía en Vázquez de Coronado y una intendencia.
[3] Los partidos cantonales Alianza por San José, Curridabat Siglo XXI, Yunta Progresista Escazuceña y Auténtico Limonense obtuvieron las alcaldías de los cantones de San José, Curridabat, Escazú y Limón respectivamente.
[3][5] Los partidos Movimiento Libertario y Renovación Costarricense que tenían 2 alcaldías cada uno en 2010 no obtuvieron ninguna en 2016.
[8] El recién formado Partido Republicano Social Cristiano, creado por el expresidente Rafael Ángel Calderón Fournier al renunciar al PUSC adoptó varios candidatos que militaron en este último, casos de Douglas Altamirano quien fue precandidato a alcalde josefino por la Unidad, renunciando para serlo en las filas republicanas.
Otro caso similar es el del músico y folclorista Dionisio Cabal, quien fue candidato vicepresidencial y a diputado de Alianza Patriótica para ahora ser candidato a alcalde de Escazú mediante el Frente Amplio.
[10] Se establecieron las siguientes coaliciones de cara a los comicios municipales:[11] Además en Acosta, Zarcero, Sarchí (entonces llamado Valverde Vega), Santo Domingo, Bagaces, Quepos y Coto Brus el Frente Amplio acordó no presentar candidatos sino respaldar la papeleta de Acción Ciudadana.
[12] Siendo la alcaldía más importante del país, ha tomado especial protagonismo en estas elecciones debido a que quien ocupó el cargo de alcalde por más de veinte años, Johnny Araya Monge, renunció a su puesto para ser candidato presidencial por el Partido Liberación Nacional en las elecciones nacionales de 2014, siendo derrotado por Luis Guillermo Solís.