En el segundo episodio, Duke sigue al Dr. Proton hacia su base secreta en la Luna.

El objetivo principal del juego es encontrar la salida de cada nivel, destruyendo enemigos y recolectando puntos.

Este problema también aparece en Cosmo's Cosmic Adventure y en Duke Nukem II.

[2]​ Después del lanzamiento del juego, Apogee fue advertida de que un villano de la serie animada Capitán Planeta se llamaba Duke Nukem,[3]​ y para evitar una demanda renombró al personaje Duke Nukum en la versión 2.0.

En 2002, un nuevo título especial fue lanzado para conmemorar el décimo aniversario del primer Duke Nukem.