En su primera temporada tan solo jugó cuatro partidos y encajó cinco goles,[cita requerida] empezó como suplente, y en las últimas jornadas sentó al portero del titular Ricardo.

En su segunda temporada, la 2004/05, ya cómo titular jugó 37 partidos y encajó 56 goles.

[cita requerida] En su última temporada en el Racing, la 2005/06 jugó 37 partidos, en los que encajó 47 goles.

Después de una temporada y media en el Real Club Deportivo de La Coruña, Dudu Aouate se vio relegado a la suplencia por Gustavo Munúa debido a su bajo rendimiento.

Durante la temporada 2013/2014 fue apartado de la portería por José Luis Oltra y Lluís Carreras para darle titularidad al hasta entonces guardameta suplente Rubén Miño.