Nanninga debutó en el VV Oosterparkers de Groninga, su ciudad natal, donde jugaba como mediapunta y delantero.

En 1973 fue transferido al primer equipo del SC Veendam y en vista de sus cualidades el técnico Cor van der Gijp le recomendó fichar por el Roda JC Kerkrade de la primera división.

Llegó a rechazar una oferta del Ajax de Ámsterdam porque prefería trabajar con su esposa en una floristería.

[3]​ El gol de Naninga no bastó: Argentina acabó derrotándoles por 3:1 en tiempo suplementario.

En julio de 2012 entró en coma y no recuperó la consciencia hasta cinco meses después.