Inició su carrera en su pueblo, Chajarí, en el Club Atlético Santa Rosa.

Es contratado por el Real Betis Balompié en la 93-94, con el que también se proclama pichichi de Segunda (26 goles) y consigue el ascenso a Primera División de España, alcanzando en la temporada 94-95 el tercer puesto en la División de Honor, clasificando al equipo verdiblanco para competición europea.

Recala posteriormente en el Rayo Vallecano de Madrid, donde es titular indiscutible jugando 40 partidos y anotando 15 goles.

En la campaña 96-97 decide regresar al Albacete Balompié, aunque ello le supone volver a actuar en Segunda División de España.

Daniel Aquino obtiene el título de entrenador nacional y dirige a diversos equipos en la cantera del Real Murcia Club de Fútbol.