Más tarde, conquista Yunkai y Meereen, donde Daenerys se instala para aprender a gobernar.

Aunque guarda muchas similitudes, la representación televisiva de Daenerys es mayor (en la adolescencia) y posee varias cualidades místicas, como una inexplicable capacidad ignífuga.

[12]​ Daenerys creció con el temor constante de ser descubierta y asesinada por los agentes del Rey Usurpador, Robert Baratheon.

Apenas siendo una recién nacida, su padre había muerto en Desembarco del Rey durante el saqueo que los Lannister sometieron a la capital y Robert Baratheon se había convertido en el nuevo Rey de los Siete Reinos.

Viserys y Daenerys vagaron los siguientes años por las Ciudades Libres buscando apoyos para su causa, pero lo único que consiguieron fueron promesas vanas.

Finalmente ambos se establecieron en Pentos, donde fueron acogidos por el rico y poderoso magíster Illyrio Mopatis.

Daenerys estaba asustada ante su compromiso, pero no tenía opción, de modo que contrajo matrimonio con Drogo.

Una noche, mientras se encontraban en la ciudad sagrada de Vaes Dothrak, un borracho Viserys viola la ley de no portar armas y apunta con una espada a Daenerys, amenazando con extraerle el bebé que esperaba si Drogo no le daba el ejército que prometió.

El khalasar de Drogo parte entonces a saquear aldeas y pueblos con los que conseguir fondos para financiar la expedición.

En uno de estos ataques, Drogo cae herido y Daenerys le pide a una maegi (bruja) llamada Mirri Maz Duur que le cure, pero la herida de Drogo termina infectándose y este queda moribundo.

Tras presenciar el milagroso acontecimiento, Ser Jorah le jura fidelidad como su reina y tres dothrakis llamados Aggo, Jhogo y Rakharo juran como sus jinetes de sangre, convirtiéndose en la primera khaleesi por derecho propio.

En los puertos de la ciudad, Daenerys está a punto de ser asesinada por una mantícora, siendo salvada en última instancia por dos sujetos, uno se hace llamar Belwas el Fuerte, mientras que el otro afirma ser su escudero, un anciano llamado Arstan Barbablanca.

Yunkai había contratado a dos compañías mercenarias, los Cuervos de la Tormenta y los Segundos Hijos, además de 4000 soldados-esclavos, aunque Ser Jorah menciona que no eran Inmaculados, sino que la mayoría eran esclavos domésticos armados y apenas entrenados.

Durante la boda, el caballero exiliado Ser Jorah Mormont promete lealtad a Daenerys y su benefactor Illyrio Mopatis le regala tres huevos de dragón petrificados.

Al amanecer, cuando el fuego se ha extinguido, Daenerys emerge con tres crías de dragón a las que llama Drogon, Rhaegal y Viserion.

[26]​ El reducido khalasar de Daenerys viaja a través del vasto Desierto Rojo.

Sin embargo, uno de los Trece llamado Xaro Xhoan Daxos (Nonso Anozie) se ofrece a cobijarlos bajo su propia responsabilidad.

Daenerys habla con los Trece para que le concedan barcos y tropas, pero todos se niegan.

Tras abrir la cámara secreta de Xaro, descubren que este le ha mentido todo el tiempo y no posee riqueza alguna.

En Astapor, un mercader esclavista llamado Kraznys mo Nakloz (Dan Hildebrand) le explica el adiestramiento que reciben los Inmaculados, ante el cual Daenerys queda asqueada, pues los Inmaculados son tratados como simples máquinas para la guerra, eliminando cualquier atisbo de humanidad en ellos.

Tanto Jorah como Barristan se oponen al plan de Daenerys, creyendo que va a cometer un error fatal.

Finalmente no es necesaria ninguna batalla, pues los esclavos terminan abriendo las puertas de la ciudad a Daenerys.

Haciendo caso omiso de sus súplicas, Daenerys exilia a Ser Jorah, ordenándole que no regrese nunca.

Viendo que son una amenaza para su propio pueblo, Daenerys decide confinar a Viserion y Rhaegal bajo la Gran Pirámide.

Cuando se hallaba caminando a través de la pradera, Daenerys es localizada por un khalasar, siendo tomada prisionera.

Daenerys permanece cautiva del khalasar de Khal Moro (Joe Naufahu), el cual no tiene planes muy esperanzadores para ella.

Daenerys se reúne con los enviados de las ciudades esclavistas, los cuales presentan sus condiciones para aceptar su rendición; sin mediar palabra, Daenerys comienza a quemar la flota esclavista a lomos de Drogon y junto con Viserion y Rhaegal.

Para ganar aliados, Daenerys convoca al recién nombrado Rey en el Norte, Jon Nieve, para que le prometa lealtad.

Al final, Cersei acepta una tregua y ayudar en la lucha contra el ejército de muertos vivientes, pero en secreto planea traicionarlos.

Daenerys destruye las defensas de la ciudad y ésta se rinde, pero quema Desembarco del Rey, matando a innumerables civiles.