La historia comenzó en realidad cuando una superheroína llamada Donna Troy murió en 2003 durante el crossover Titanes/Justicia joven: Día de graduación.
Blue Beetle descubre que alguien ha estado robando dinero de Industrias Kord.
En solitario, Blue Beetle recorre un intrincado laberinto de engaños siguiendo la única pista que tiene: un proyecto llamado O.M.A.C.
En esta historia, los OMAC son humanos modificados cuya función es destruir a los metahumanos y que son activados mediante “Hermano Ojo”, un satélite construido por Batman que luego fue manipulado por una fuerza desconocida.
La aparición de Rann supuestamente ha ocasionado que Thanagar se aproxime a su sol, generando desastres en todo el planeta.
Como ya es norma en todo gran crossover, Crisis Infinita presentó una amplia cantidad de tie-ins.
En consecuencia, pese a que en sí misma Crisis Infinita posee sólo siete números, existen numerosas publicaciones que se conectan tanto directa como indirectamente con el argumento principal de la saga.
Aquí se narra que Superman tiene visiones donde diferentes villanos atacan a Lois Lane.
Superman, enloquecido, ataca a Batman sin darse cuenta y casi lo mata.
La Mujer Maravilla interviene tras descubrir que hay alguien detrás de las alucinaciones.
Despero le devuelve los recuerdos a la Sociedad Secreta de Super Villanos (la Liga los había lobotomizado al igual que hicieron con Batman).
Booster Gold busca al escarabajo de Blue Beetle y lo encuentra fusionado a la columna de un chico llamado Jaime Reyes el cual se ha convertido en el nuevo Blue Beetle.
La Mujer Maravilla calma a Kal-L y le dice que todos fueron utilizados por Alexander Luthor.
Todas la Tierras se combinan y vuelven a la normalidad, Superboy (Conner) muere.