Su primera edición se disputó en 2007[1]​ y actualmente se disputa como una sucesora de la Copa Campeón de Campeones de Santa Fe en paralelo a la Copa Santa Fe.

El torneo gozaba de una gran jerarquía ya que enfrentaba a los clubes más fuertes de toda la provincia.

Luego de un tiempo la Copa Campeón de Campeones de Santa Fe dejó de disputarse, y unos años después durante la década del 2000 apareció la Copa Federación, un torneo que buscaba asemejarse su antecesor pero que no tuvo el mismo éxito, jerarquía e importancia ya que muchos clubes campeones rechazaban su cupo y la Federación Santafesina de Fútbol debía realizar invitaciones a otros equipos para poder llevar a cabo el torneo.

Por esta razón la Copa Federación se convirtió en una competencia en la que la mayoría de los participantes son clubes amateurs y/o que no gozan de gran peso en sus respectivas ligas regionales.

De hecho, la propia Copa Federación otorga plazas para disputar dicho torneo[4]​ y desde su edición 2022 también le otorga un cupo al campeón para disputar el Torneo Regional Federal Amateur.