Y enseña Historia natural en la "Escuela Nacional Santa Trinidad, en Lambeth, y posteriormente será curador del "Museo de India" en la India Office de 1860 a 1879.

En 1879 cuando las colecciones botánicas del Museo de India se transfieren al Real Jardín Botánico de Kew, Cooke va con ellas.

Recibió varios galardones y diplomas honorario por su obra, primariamente con hongos, un Master of Arts de la St.

Junto con Edward Step (1855-1931), publicó el mensuario Hardwicke's Science Gossip: A Monthly Medium of Interchange & Gossip for Students & Lovers of Nature de 1865 a 1893.

Y de 1872 a 1894 Cooke también edita, Grevillea, a monthly record of cryptogamic botany and its literature, una revista periódica especiela para estudiosos ed musgos.