Como júnior, Chuck acudió al Modesto Christian High School en California, donde fue nombrado All-League y All-State.

Como freshman en la temporada 2001-02 empezó a dejar cuenta de sus capacidades con 5.9 puntos y 4.5 rebotes.

El equipo alcanzó la Sweet Sixteen (semifinales regionales) del torneo NCAA, donde cayeron ante Maryland.

Durante sus próximas tres temporadas aportó al resurgimiento de los Wildcats junto con Keith Bogans, Gerald Fitch, Erik Daniels y Kelenna Azubuike.

En el torneo final no alcanzaron las cotas de años anteriores y se estancaron en la 2ª ronda, donde fueron derrotados por los UAB Blazers.

Chuck estaba ante su última oportunidad de hacer algo grando con Kentucky, pero se quedaron más cerca que nunca.

Fue entonces cuando Hayes fue elegido por Albuquerque Thunderbirds en el puesto 6 del draft de la NBDL.

En su segundo partido con Houston se registró un doble-doble de 12 puntos y 13 rebotes ante Chicago Bulls.