Era sobrino de Thomas Babington Macaulay.

Realiza sus estudios en el Colegio St John de Cambridge y obtiene su Bachillerato en Artes en 1830 y el grado de Maestro de las Artes en 1833.

Su herbario y su biblioteca se conservan en la Universidad de Cambridge.

El género Babingtonia fue nombrado en su honor.

La abreviatura Babington se emplea para indicar a Charles Cardale Babington como autoridad en la descripción y taxonomía en zoología.