Actualmente tiene su sede junto a la Base de Torrejón (Madrid).
También participa en los procesos de selección del personal volante y realiza labores de docencia e investigación en los campos relacionados con su actividad.
En 1940 se inauguraron los Institutos de Medicina Aeronáutica de Madrid y Sevilla, a los que les sucedió dos años más tarde el Centro de Investigación de Medicina Aeronáutica, CIMA, que estuvo ubicado en la Ciudad Universitaria.
En 1974 el CIMA trasladó su sede al recinto del Hospital del Aire, situado en la calle Arturo Soria de Madrid.
Once años después se decidió su reincorporación al Ejército del Aire.