[3]​ En sus primeros años, se centró principalmente en programas técnicos y de nivel medio superior.

Esto le ha permitido ofrecer a los estudiantes oportunidades de intercambio, investigación y movilidad académica.

[5]​ A lo largo de los años, CETYS Universidad se ha especializado en áreas como negocios, ingeniería, ciencias sociales y humanidades.

Ha contribuido al desarrollo de la región y formado profesionales que han tenido un impacto en diversos sectores.

En 1966, del CETYS Universidad gradúa a la primera generación de profesionistas en Ingeniería, Contabilidad y Administración, en Baja California.