Jancker se inició en las categorías inferiores del Hansa Rostock, para pasar al FC Colonia, haciendo su debut en 1995.

Tras escasas participaciones, fue cedido al Rapid Viena esa misma temporada, marcando 14 goles con el equipo austríaco.

Tras sus pobres actuaciones, fue descartado en octubre y aceptó fichar por el SV Mattersburg en el mercado de invierno.

En junio de 2009 se anunció que el Mattersburg no quería seguir trabajando con Jancker debido a su estado físico.

Con la selección de Alemania no tuvo el rendimiento esperado y fueron pocos los partidos que jugó con el equipo nacional.