Comprende 18 especies descritas y de estas, solo 15 aceptadas.
El género fue descrito por Robert Hermann Schomburgk y publicado en Linnaea, 20: 759, 1847.
[1] La especie tipo es: Gongylolepis benthamiana R.H.Schomb.
A continuación se brinda un listado de las especies del género Gongylolepis aceptadas hasta julio de 2012, ordenadas alfabéticamente.
Para cada una se indica el nombre binomial seguido del autor, abreviado según las convenciones y usos.