El Campeonato Brasileño de Serie D 2016 fue la octava (8ª) edición del campeonato de cuarta categoría del fútbol brasileño.

Para esta edición, cuenta con la participación de 68 equipos, los cuales clasificaron por sus respectivos torneos estatales o por campeonatos organizados por cada una de las federaciones.

Se jugarán partidos de ida y vuelta entre los equipos de cada grupo, llegando a máximo seis partidos en la primera fase.

Finalmente, los cuatro equipos clasificados a la semifinal serán ascendidos al Campeonato Brasileño de Fútbol Serie C 2017.

De acuerdo con esto, cada estado tiene los siguientes cupos para el campeonato: De esta manera, los equipos clasificados son: Los 32 equipos clasificados a la segunda fase serán divididos en llaves en las que se jugarán partidos de ida y vuelta para definir a los 16 clasificados a la fase final del campeonato.