La familia y el género están presentes desde el cretácico superior (Muzzopapa-Nicoli, 2010) constituyendo un especial caso de longevidad taxonómica.

Sus fósiles pueden encontrarse en Argentina para el Cretácico de Río Negro, un ejemplar del género Calyptocephalella (Báez, 1987) y en Chubut para el Oligoceno con numerosos restos fósiles que corresponderían a Calyptocephalella canqueli.

No se conoce aún la extensión del área paleobiogeografica al que correspondería este batracio, sí se supone una muy amplia y exitosa distribución que incluiría a la actual península antártica durante el Paleoceno y Eoceno y la región más austral del continente sudamericano, comprendiendo que sus fósiles no han sido hallados en la región septentrional del neotrópico.

El grupo fue inicialmente nombrado Batrachophrynidae,[3]​ siendo renombrada más tarde como Calyptocephalellidae[4]​ tras estudios cariotípicos que agruparon al género Batrachophrynus en el grupo Ceratophryidae.

MUZZOPPAPA, Paula y BAEZ, Ana M. Status sistemático del anuro neobatracio Calyptocephalella canquelli del Terciario medio de la Patagonia (Argentina) con comentarios sobre la evolución del género.